普通野生稻優異基因發掘平臺建立

　　記者11日從中國農業科學院獲悉，該院作物科學研究所水稻優異種質資源創新利用團隊聯合北京大學現代農學院，首次組裝了普通野生稻單倍型無間隙染色體基因組，構建了野生稻種質資源優異基因發掘利用與種質創新平臺，并鑒定了關鍵的耐鹽與抗稻瘟病基因。相關研究成果日前發表在國際期刊《自然?通訊》上。

　　栽培稻是從二倍體普通野生稻馴化而來，現在已成為世界上超過一半人口的主食。然而，在栽培稻的馴化和育種過程中，非生物耐受性和生物抗性等許多有益性狀丟失或者被削弱。而且，野生稻雜合度高導致基因組組裝困難，大量優異抗性基因與不利性狀連鎖，育種中更難以直接利用。所以，建立一個可用于野生稻基因發掘的高效平臺，對于野生稻資源利用和水稻品種改良具有重要意義。

　　論文通訊作者、中國農業科學院作物科學研究所研究員楊慶文告訴記者，研究團隊以綜合抗性優良的中國普通野生稻“Y476”為載體，首次組裝了單倍型無間隙染色體基因組。他們以此為基礎，分別以秈稻“9311”和粳稻“日本晴”為受體親本，構建了兩套覆蓋全基因組的染色體片段置換系，創建了一個能夠高通量鑒定發掘野生稻優異基因的平臺。

　　“在這項工作中，我們通過整合高通量高分辨率染色體構象捕捉、全基因組光學圖譜、納米孔測序和高保真測序等技術，對二倍體普通野生稻種質進行單倍型解析的無間隙基因組組裝和注釋。與之前組裝的二倍體普通野生稻基因組相比，該基因組組裝在連續性、完整性和正確性方面有了顯著改善。這意味著，該平臺將加速野生稻的功能基因組學研究，并為稻種資源利用與品種遺傳改良提供先進工具。”楊慶文說。